Con el objetivo de colaborar en el campo de la expansión de las tecnologías de secuenciación masiva o de nueva generación de ADN y ARN, que implican un gran esfuerzo bioinformático para diseñar o desarrollar algoritmos que analicen los datos generados con la mayor eficacia posible, el bioinformático Osvaldo Graña Castro abordó en su tesis de doctorado el diseño y desarrollo de tres pipelines, como se denomina al software que ejecuta programas requeridos dentro de una secuencia ordenada lógica.
Estos pipelines de aplicación en el análisis de datos procedentes de secuenciación masiva, concretamente en el análisis de la expresión y metilación de genes y en la identificación y cuantificación de poblaciones bacterianas en muestras biológicas.
La tesis, titulada Diseño y desarrollo de workflows software para el análisis de datos procedentes de secuenciación masiva, estuvo dirigida por Daniel González Peña, miembro del grupo de investigación SING ( ‘Next Generation Computer Systems Group’) y profesor de la Escuela Superior de Ingeniería Informática del campus de Ourense, y Alfonso Valencia Herrera, director del Instituto Nacional de Bioinformática y profesor de investigación ICREA en el Barcelona Supercomputing Center. Fue realizada en el marco del Programa de Doctorado en Sistemas de Software Inteligentes y Adaptables de la UVigo y presentada este curso académico de manera telemática. El trabajo presentado en esta tesis, indica Osvaldo Graña, nació en el 2014 en base a necesidades de la Unidad de Bioinformática del Centro Nacional de Investigaciones Oncológicas, donde trabaja, y con la colaboración con el grupo de investigación SING.
La tesis surge, según explica su autor, en un contexto en el que la secuenciación masiva ha irrumpido con mucha fuerza en el campo de la biología molecular y de la genómica, “con una implicación clara en la práctica clínica, abriendo un nuevo escenario en ciertas enfermedades con base genética, como por ejemplo el cáncer, donde está sirviendo como un elemento adicional para establecer un diagnóstico, estimar el pronóstico, sugerir un tratamiento o bien predecir la respuesta al mismo” ,indica el científico.
