El Banco de España abonó una indemnización equivalente a la de despido improcedente a su anterior secretario general, José Antonio Alepuz, a pesar de que su abandono del cargo en septiembre de 2011 se produjo "por voluntad propia para iniciar una nueva actividad". Este cambio profesional fue para trabajar en uno de los mayores bancos del país. Así lo señaló el Tribunal de Cuentas en un informe en el que se ha fiscalizado la política retributiva del supervisor bancario.

En dicho documento se recuerda que en septiembre de 2011 la Comisión Ejecutiva del Banco de España aceptó la "renuncia voluntaria" de Alepuz, secretario general desde 2002, que había aceptado una oferta de trabajo en una entidad sometida a la supervisión del organismo público. El Banco de España prohíbe que el secretario general pueda trabajar con entidades o percibir de ellas retribución alguna durante seis meses desde el cese y reconoce una compensación económica por ello. Pero Alepuz ingresó 41.485 euros entre octubre y diciembre de 2011, otro tanto entre enero y marzo de 2012, y una compensación de 281.476 euros de indemnización en abril de 2012, cuando ya realizaba su actividad en La Caixa.