Investigadores gallegos coordinan el primer ‘mapa’ de superbacterias de España
Científicos del Inibic coruñés y del Centro Nacional de Análisis Genómico crean una base de datos con ADN de cientos de cepas resistentes a antibióticos
María de la Huerta
“Aportar conocimiento” sobre “dónde están las bacterias resistentes” a antibióticos, “cómo son y cómo se han diseminado” y, por tanto, sobre “cómo pueden ser tratadas”, es el objetivo de un “estudio colaborativo” de “aplicación traslacional”, coordinado por el Grupo de Investigación de Microbiología del Instituto de Investigación Biomédica (Inibic)-Complexo Hospitalario Universitario de A Coruña (Chuac) y el Centro Nacional de Análisis Genómico (CNAG), y financiado por Roche Diagnostics, que ha dado lugar al primer “mapa” de superbacterias en España. Una base de datos digital con ADN de casi medio millar de cepas bacterianas resistentes a antibióticos, recogidas de 41 hospitales de trece comunidades autónomas, que “complementa” el perfil genómico de esos patógenos “con datos clínicos, geográficos y microbiológicos”, y con otros estudios online relacionados con la resistencia antimicrobiana. Una amenaza para la salud pública global, sobre la que los Centros para el Control y Prevención de Enfermedades (CDC) de Estados Unidos y la propia Organización Mundial de la Salud (OMS) llevan tiempo aconsejando “estrechar la vigilancia”.
“Una de las estrategias que proponen los CDC estadounidenses para el control de la resistencia antimicrobiana es la vigilancia y monitoreo de patógenos resistentes o multirresistentes. La base de datos que hemos creado permite, precisamente, la identificación, localización y seguimiento de bacterias gramnegativas que portan uno de los mecanismos de resistencia a antibióticos más peligrosos, las enzimas llamadas carbapenemasas”, explica el doctor Germán Bou, responsable del Grupo de Investigación de Microbiología del Inibic y jefe del Servicio de Microbiología del Chuac, quien avanza que el trabajo llevado a cabo con el CNAG y Roche Diagnostics, publicado recientemente en la revista científica “Microbial Genetics”, puede servir para “futuros estudios con un mayor número de casos aislados o cepas que incluyan una mayor diversidad de patógenos resistentes”.
“Nuestra idea, cuando iniciamos este proyecto era, por supuesto, estudiar las enterobacterias resistentes a carbapenémicos (unos antibióticos de última generación muy importantes para el tratamiento de infecciones), pero que esto fuese extrapolable, o ampliable, a otras bacterias resistentes. Esto se puede hacer actualizando la base de datos con nuevos genomas de este tipo de mecanismo de resistencia, o de otras superbacterias, que ahora no hemos abordado por una cuestión de tiempo o recursos, no obstante, es un proyecto abierto a nuevos desarrollos”, resalta el doctor Bou.
La primera base de datos digital de España con ADN de casi medio millar de cepas de bacterias resistentes a antibióticos ha sido posible gracias a una nueva metodología de secuenciación, que permite obtener genomas bacterianos completos de manera mucho más rápida y a gran escala, posibilitando realizar un seguimiento rutinario de los patrones de transmisión de esa resistencia.
“El análisis genómico fue lo que nosotros llamamos un ‘híbrido’ entre secuencias de lecturas largas y cortas, lo cual permite no solo leer o entender los cromosomas bacterianos, sino también los plásmidos [moléculas de ADN extracromosómicas], muy difíciles de caracterizar sin utilizar esta estrategia”, explica el doctor Bou, quien detalla que “los plásmidos portan, muchas veces, genes de resistencia”.
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