Los investigadores de la Estación de Hidrobioloxía Encoro do Con tiene en marcha siete proyectos. Uno con la Comunidad de Madrid sobre la mosca negra, otro con Perú sobre el efecto de la minería clandestina en las aguas de los ríos de Arequipa, otro con Ecuador sobre las comunidades de invertebrados acuáticos en los humedales del Chimborazo y tres europeos. Son el "Migramiño", sobre la protección y conservación de los peces migradores en el tramo internacional del río Miño y sus afluentes; el "Invasaqua", sobre especies exóticas invasoras de agua dulce y sistemas estuarinos en la Península Ibérica; y el "Diades", que se centra en la evaluación y mejora de los servicios de los ecosistemas proporcionados por peces biágromos en un entorno con cambio climático. El séptimo sería el análisis de las aguas que el Umia suministra a Caldas, pero está suspendido.
Además, están solicitados tres proyectos: uno sobre la teledetección de cianobacterias (de aprobarse se haría en el embalse de Caldas), otro sobre el estudio de las alosas -un tipo de pez- en las costas gallegas y un tercero sobre las aguas dulces del Parque Nacional das Illas Atlánticas.
