Una de las cuestiones que más preocupa al sector mejillonero son los efectos de las mareas rojas o tóxicas, que, en los últimos años, tienen cada vez mayor incidencia. Juan Carlos Juncal, responsable de la asociación de Corón, señala que "no se ha avanzado nada en la investigación sobre cuales son las causas que la provocan; sabemos que es un incremento espectacular de la presencia de nutrientes en las aguas, pero no se ha avanzado nada en la búsqueda de soluciones para atajarlas". Además, desde el sector entienden que se necesita "una mayor seguridad jurídica en el control de estas mareas, como una interpretación uniforme en toda la Unión Europea de las analíticas". Su compañero, Alfredo Otero, señala que "los controles son mucho más exhaustivos para el mejillón gallego, algo que vemos positivo, pero entendemos que si se exportan otros productos deben pasar los mismos controles y tener las mismas garantías sanitarias que el nuestro, algo que no ocurre en estos momentos".
Juncal también incidió en la necesidad de sanear las rías, ya que "por muchas campañas publicitarias que se realicen, desde hace cuatro años para acá nos estamos encontrando con que muchos polígonos están pasando de calidad A a B, lo que indica que el saneamiento integral de la ría no existe". Insiste Juncal en que "queremos que se depuren las aguas de la ría de Arousa".
