Ciudadanos atribuye a diferencias en los criterios contables las advertencias del Tribunal de Cuentas sobre su contabilidad recogidas en el último informe del ente fiscalizador, que abarca los ejercicios de 2014 y 2015. Para la formación naranja se trata "simplemente de una cuestión de apreciación contable": mientras que el Tribunal de Cuentas considera que hay que contabilizar unos recursos cuando se conceden, Ciudadanos los anota "cuando se ingresaban". El informe de ente fiscalizador considera, a la vista de sus números, que existen demasiadas incidencias, deficiencias y discrepancias que impiden reflejar adecuadamente la situación financiera y patrimonial de Ciudadanos. Para Carlos Carrizosa, portavoz parlamentario catalán y miembro de la Ejecutiva del partido, lo único que hay es "una diferencia de criterio en cuanto al momento de declarar las subvenciones", que C's contabiliza en el momento de su ingreso efectivo.
